Stitch, az univerzum legveszélyesebb, egyben legpihepuhább teremtménye szó szerint berobban a feudális Japán, valamint Jamato Meiszon, az ádáz hadúr életébe. Kísértetekkel barátkozik, történelemszakértővé avanzsál, megnehezíti Meiszon és a körülötte lévők életét... Vagyis hozza a formáját. A Galaktikus Szövetség azonban nem engedheti, hogy Stitch és a nyomában járó káosz elszabaduljon a Földön, ezért Jumba és Pleakley az emberek közé vegyülve próbálja elkapni a szökevényt, mindez azonban olyan változásokat eredményez, amelyekkel még egy rettegett szamurájnak és seregének is nehéz lesz megbirkóznia.